Machinery

Из словаря Merriam-Webster’s Advanced Learner’s Dictionary (En-En)

machinery /m???i?n?ri/noun [noncount]

1: machines of a particular kind or machines in general
Some of the mill’s machinery was damaged in the fire.
a piece of farm machinery

2: the working parts of a machine
Something was clogging the machinery.

3: an organization or system by which something is done
the machinery of government
The United Nations has set up machinery for mediation.

machinery — group of large machines or the parts of a machine which make it work- Cambridge Advanced Learners Dictionary 3th Ed.

You can use machinery to refer to machines in general, or machines that are used in a factory or on a farm — Collins COBUILD 5.

There____a lot of machinery in the shop and skilled workers operated ____.

A. was, them
B. were, them
C. were, it
D. was, it

Так как слово machinery в нашем примере (первый пропуск) неисчисляемое существительное (refers to machines in general), исключим варианты В и С. Выбираем между А и D.

Что имеется в виду под тем, что skilled workers operated? Очевидно, не собирательное существительное. Выбираем B.

There was a lot of machinery in the shop and skilled workers operated them.

Сложность выбора заключается в том, что местоимение может восприниматься как заместитель собирательного существительного по числу — was/it. Как видите, вариант с it неверный.